Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3072F6SKY8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3072F6SKY8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms