Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syngap1F6SEU4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syngap1F6SEU4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms