Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cald1E9QA15 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cald1E9QA15 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cald1E9QA15 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms