Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9V5

Ms4a7, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 7, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a7E9Q9V5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Ms4a7E9Q9V5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a7E9Q9V5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms