Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc74aE9Q9U8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc74aE9Q9U8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms