Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930451I11RikE9Q9R3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4930451I11RikE9Q9R3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930451I11RikE9Q9R3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930451I11RikE9Q9R3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms