Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrdnE9Q9K5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms