Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc146E9Q9F7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc146E9Q9F7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc146E9Q9F7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms