Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp31E9Q6Y8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms