Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga10E9Q6R1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga10E9Q6R1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms