Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc85cE9Q6B2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc85cE9Q6B2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms