Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BC005561E9Q5E2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
BC005561E9Q5E2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
BC005561E9Q5E2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BC005561E9Q5E2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BC005561E9Q5E2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BC005561E9Q5E2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BC005561E9Q5E2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BC005561E9Q5E2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
BC005561E9Q5E2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
BC005561E9Q5E2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
BC005561E9Q5E2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BC005561E9Q5E2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BC005561E9Q5E2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BC005561E9Q5E2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BC005561E9Q5E2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
BC005561E9Q5E2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
BC005561E9Q5E2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BC005561E9Q5E2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BC005561E9Q5E2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BC005561E9Q5E2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BC005561E9Q5E2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BC005561E9Q5E2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BC005561E9Q5E2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BC005561E9Q5E2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BC005561E9Q5E2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BC005561E9Q5E2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms