Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DspE9Q557 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DspE9Q557 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DspE9Q557 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DspE9Q557 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DspE9Q557 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DspE9Q557 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DspE9Q557 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DspE9Q557 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DspE9Q557 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DspE9Q557 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms