Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20518E9Q548 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20518E9Q548 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms