Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm17175E9Q528 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm17175E9Q528 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms