Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip11E9Q512 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trip11E9Q512 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trip11E9Q512 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms