Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
8030474K03RikE9Q4Y8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
8030474K03RikE9Q4Y8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
8030474K03RikE9Q4Y8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
8030474K03RikE9Q4Y8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
8030474K03RikE9Q4Y8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
8030474K03RikE9Q4Y8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
8030474K03RikE9Q4Y8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
8030474K03RikE9Q4Y8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
8030474K03RikE9Q4Y8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
8030474K03RikE9Q4Y8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
8030474K03RikE9Q4Y8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
8030474K03RikE9Q4Y8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
8030474K03RikE9Q4Y8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
8030474K03RikE9Q4Y8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
8030474K03RikE9Q4Y8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
8030474K03RikE9Q4Y8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
8030474K03RikE9Q4Y8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
8030474K03RikE9Q4Y8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
8030474K03RikE9Q4Y8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms