Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm17727E9Q4V7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm17727E9Q4V7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm17727E9Q4V7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm17727E9Q4V7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm17727E9Q4V7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm17727E9Q4V7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm17727E9Q4V7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm17727E9Q4V7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm17727E9Q4V7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm17727E9Q4V7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm17727E9Q4V7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm17727E9Q4V7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm17727E9Q4V7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm17727E9Q4V7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm17727E9Q4V7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17727E9Q4V7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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