Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930579F01RikE9Q3L6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930579F01RikE9Q3L6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930579F01RikE9Q3L6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms