Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
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Zfp558E9Q1J0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Zfp558E9Q1J0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp558E9Q1J0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Zfp558E9Q1J0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Zfp558E9Q1J0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Zfp558E9Q1J0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Zfp558E9Q1J0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Zfp558E9Q1J0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Zfp558E9Q1J0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Zfp558E9Q1J0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Zfp558E9Q1J0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Zfp558E9Q1J0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp558E9Q1J0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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