Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myo5cE9Q1F5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
Myo5cE9Q1F5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myo5cE9Q1F5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myo5cE9Q1F5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myo5cE9Q1F5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myo5cE9Q1F5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myo5cE9Q1F5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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