Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms