Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cdr1E9Q0B4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cdr1E9Q0B4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms