Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Parp4E9PYK3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Parp4E9PYK3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Parp4E9PYK3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Parp4E9PYK3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp4E9PYK3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp4E9PYK3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp4E9PYK3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp4E9PYK3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp4E9PYK3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp4E9PYK3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp4E9PYK3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp4E9PYK3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp4E9PYK3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Parp4E9PYK3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Parp4E9PYK3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms