Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM3

Vmn1r177, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r177E9PXM3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r177E9PXM3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r177E9PXM3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r177E9PXM3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r177E9PXM3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r177E9PXM3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r177E9PXM3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r177E9PXM3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r177E9PXM3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r177E9PXM3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r177E9PXM3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r177E9PXM3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r177E9PXM3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r177E9PXM3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms