Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5415E9PXF3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm5415E9PXF3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm5415E9PXF3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms