Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim5E9PV98 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim5E9PV98 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms