Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl3E0CZ16 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Klhl3E0CZ16 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl3E0CZ16 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms