Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hfm1D3Z4R1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Hfm1D3Z4R1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hfm1D3Z4R1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms