Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2W7

Cyp3a59, Cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 59, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a59D3Z2W7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp3a59D3Z2W7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp3a59D3Z2W7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp3a59D3Z2W7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp3a59D3Z2W7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp3a59D3Z2W7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp3a59D3Z2W7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp3a59D3Z2W7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp3a59D3Z2W7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp3a59D3Z2W7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp3a59D3Z2W7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp3a59D3Z2W7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp3a59D3Z2W7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp3a59D3Z2W7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp3a59D3Z2W7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp3a59D3Z2W7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp3a59D3Z2W7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp3a59D3Z2W7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp3a59D3Z2W7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp3a59D3Z2W7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms