Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms