Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem200bD3Z0P8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem200bD3Z0P8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem200bD3Z0P8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem200bD3Z0P8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200bD3Z0P8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200bD3Z0P8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200bD3Z0P8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200bD3Z0P8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200bD3Z0P8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200bD3Z0P8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem200bD3Z0P8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200bD3Z0P8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200bD3Z0P8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200bD3Z0P8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200bD3Z0P8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200bD3Z0P8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200bD3Z0P8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200bD3Z0P8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200bD3Z0P8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200bD3Z0P8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem200bD3Z0P8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem200bD3Z0P8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms