Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc8D3YZV8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc8D3YZV8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms