Protein–RNA interactions for Protein: B9UIU9

Gm17660, Predicted gene, 17660, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17660B9UIU9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17660B9UIU9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms