Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clip3B9EHT4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clip3B9EHT4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Clip3B9EHT4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clip3B9EHT4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clip3B9EHT4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clip3B9EHT4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Clip3B9EHT4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clip3B9EHT4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clip3B9EHT4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clip3B9EHT4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clip3B9EHT4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clip3B9EHT4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clip3B9EHT4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clip3B9EHT4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clip3B9EHT4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clip3B9EHT4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clip3B9EHT4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clip3B9EHT4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clip3B9EHT4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Clip3B9EHT4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clip3B9EHT4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clip3B9EHT4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clip3B9EHT4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clip3B9EHT4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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