Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Gm20547B8JJN0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Gm20547B8JJN0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Gm20547B8JJN0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Gm20547B8JJN0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20547B8JJN0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Gm20547B8JJN0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20547B8JJN0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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