Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrt4B2RU40 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prrt4B2RU40 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms