Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rrn3B2RS91 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rrn3B2RS91 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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