Protein–RNA interactions for Protein: B2RQT2

Vmn1r5, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r5B2RQT2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r5B2RQT2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r5B2RQT2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms