Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zbed5B2RPU8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zbed5B2RPU8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms