Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Uhrf1bp1B2KF50 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Uhrf1bp1B2KF50 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uhrf1bp1B2KF50 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms