Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col4a6B1AVK5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col4a6B1AVK5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 692.9 ms