Protein–RNA interactions for Protein: B1AVH7

Tbc1d2, TBC1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2B1AVH7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tbc1d2B1AVH7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbc1d2B1AVH7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d2B1AVH7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d2B1AVH7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d2B1AVH7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d2B1AVH7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d2B1AVH7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d2B1AVH7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d2B1AVH7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d2B1AVH7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d2B1AVH7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d2B1AVH7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d2B1AVH7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms