Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spocd1B1ASB6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spocd1B1ASB6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spocd1B1ASB6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms