Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prr29B1ARI9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr29B1ARI9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms