Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox1B1APN4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms