Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Supt3B0QZW4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms