Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Skint2A7XUX6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms