Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930435E12RikA6X8Z9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms