Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc9bA3KGF9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc9bA3KGF9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms